Details for gene set INTRACELLULAR

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	INTRACELLULAR_TRANSPORT
Enrichment Score (ES)	0.17882958
Normalized Enrichment Score (NES)	3.4311292
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.0
FWER p-Value	0.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CLEC4M	291	1.223	-0.0122	Yes
2	LTBP2	751	0.639	-0.0336	Yes
3	AP1M2	878	0.576	-0.0369	Yes
4	NXF5	1282	0.410	-0.0552	Yes
5	BCL2	1364	0.382	-0.0560	Yes
6	MYH10	1393	0.374	-0.0539	Yes
7	DOPEY1	1679	0.315	-0.0658	Yes
8	TNF	1751	0.302	-0.0660	Yes
9	ABCG1	1755	0.301	-0.0626	Yes
10	KIF13B	1776	0.296	-0.0600	Yes
11	SCG5	1850	0.285	-0.0604	Yes
12	SNAP23	1884	0.279	-0.0586	Yes
13	ARSB	2050	0.256	-0.0639	Yes
14	KIF4A	2092	0.252	-0.0625	Yes
15	DUSP16	2100	0.251	-0.0593	Yes
16	TPR	2224	0.237	-0.0624	Yes
17	EEA1	2395	0.218	-0.0680	Yes
18	MALT1	2440	0.214	-0.0668	Yes
19	KIF5A	2553	0.205	-0.0693	Yes
20	TSC1	2609	0.201	-0.0686	Yes
21	ZFYVE16	2632	0.199	-0.0662	Yes
22	AP3B2	2660	0.196	-0.0641	Yes
23	CD209	2668	0.196	-0.0608	Yes
24	SMG1	2672	0.195	-0.0574	Yes
25	F2	2682	0.195	-0.0542	Yes
26	GABARAP	2702	0.193	-0.0516	Yes
27	MON2	2772	0.187	-0.0518	Yes
28	NPC2	2808	0.185	-0.0501	Yes
29	KIF5B	3025	0.171	-0.0582	Yes
30	NF1	3060	0.169	-0.0564	Yes
31	SYNRG	3123	0.165	-0.0562	Yes
32	MYH7	3282	0.156	-0.0612	Yes
33	KIF1B	3377	0.152	-0.0627	Yes
34	MYO1E	3404	0.150	-0.0605	Yes
35	TRPS1	3468	0.147	-0.0603	Yes
36	FYB	3497	0.145	-0.0582	Yes
37	RAB3GAP2	3520	0.144	-0.0558	Yes
38	PEX12	3536	0.144	-0.0529	Yes
39	RANBP2	3549	0.143	-0.0500	Yes
40	MYO6	3620	0.139	-0.0502	Yes
41	CDH1	3669	0.137	-0.0492	Yes
42	NLGN1	3765	0.133	-0.0507	Yes
43	MFN2	3841	0.129	-0.0512	Yes
44	KPNA2	3854	0.128	-0.0482	Yes
45	GSK3B	3855	0.128	-0.0446	Yes
46	F2R	3970	0.124	-0.0472	Yes
47	ATP2C1	4035	0.121	-0.0470	Yes
48	SEC22C	4054	0.120	-0.0444	Yes
49	XPO7	4179	0.115	-0.0475	Yes
50	CSPG5	4324	0.111	-0.0517	Yes
51	APBA1	4342	0.110	-0.0491	Yes
52	GBF1	4525	0.104	-0.0553	Yes
53	ANP32A	4581	0.102	-0.0547	Yes
54	ABCA1	4659	0.099	-0.0553	Yes
55	STAP1	4716	0.097	-0.0547	Yes
56	CALR	4768	0.095	-0.0539	Yes
57	ATXN1	4823	0.094	-0.0532	Yes
58	UPF2	4824	0.094	-0.0496	Yes
59	RAB2A	4848	0.093	-0.0472	Yes
60	APPBP2	4866	0.092	-0.0445	Yes
61	NCKIPSD	4929	0.091	-0.0443	Yes
62	IPO5	5029	0.088	-0.0460	Yes
63	COG3	5052	0.087	-0.0436	Yes
64	NUP160	5111	0.086	-0.0431	Yes
65	HPS4	5223	0.082	-0.0456	Yes
66	LMAN1	5243	0.082	-0.0430	Yes
67	SRSF10	5245	0.082	-0.0394	Yes
68	STX16	5353	0.079	-0.0416	Yes
69	AKT1	5405	0.078	-0.0408	Yes
70	UPF1	5501	0.075	-0.0423	Yes
71	STX7	5752	0.068	-0.0523	Yes
72	GLI3	5757	0.068	-0.0489	Yes
73	RHOB	5828	0.066	-0.0491	Yes
74	CEP57	5838	0.066	-0.0460	Yes
75	STEAP2	5850	0.066	-0.0429	Yes
76	TIMM17B	5858	0.066	-0.0397	Yes
77	VPS45	5913	0.064	-0.0390	Yes
78	NUP133	6040	0.061	-0.0423	Yes
79	SCAMP1	6065	0.061	-0.0399	Yes
80	NUP98	6087	0.060	-0.0375	Yes
81	SEC62	6161	0.059	-0.0378	Yes
82	ERP29	6168	0.058	-0.0345	Yes
83	HNRNPA1	6191	0.058	-0.0321	Yes
84	NAPG	6239	0.057	-0.0310	Yes
85	RTP4	6267	0.056	-0.0289	Yes
86	TBRG1	6319	0.055	-0.0280	Yes
87	SEC23IP	6391	0.053	-0.0283	Yes
88	RERE	6425	0.052	-0.0265	Yes
89	DERL1	6457	0.051	-0.0245	Yes
90	VTI1A	6463	0.051	-0.0212	Yes
91	NPM1	6508	0.050	-0.0199	Yes
92	KPNA4	6605	0.048	-0.0216	Yes
93	UHMK1	6698	0.046	-0.0229	Yes
94	KHDRBS1	6737	0.045	-0.0214	Yes
95	BARD1	6792	0.044	-0.0207	Yes
96	NUP107	6800	0.044	-0.0175	Yes
97	OPTN	6806	0.044	-0.0141	Yes
98	ZFYVE9	6810	0.044	-0.0107	Yes
99	KPNA5	6823	0.043	-0.0077	Yes
100	MCM3AP	6835	0.043	-0.0047	Yes
101	NUP214	6939	0.041	-0.0067	Yes
102	PEX19	6988	0.040	-0.0056	Yes
103	AGFG1	6999	0.040	-0.0026	Yes
104	TRAK1	7060	0.038	-0.0022	Yes
105	CBLB	7063	0.038	0.0013	Yes
106	PEX1	7066	0.038	0.0048	Yes
107	ARCN1	7134	0.037	0.0048	Yes
108	VCP	7136	0.036	0.0084	Yes
109	ICMT	7189	0.035	0.0091	Yes
110	KIF1C	7267	0.034	0.0086	Yes
111	TGFB1	7321	0.033	0.0093	Yes
112	GOSR1	7360	0.032	0.0109	Yes
113	ERGIC1	7365	0.032	0.0143	Yes
114	TMED10	7449	0.030	0.0134	Yes
115	NUP205	7472	0.029	0.0158	Yes
116	EXOC5	7474	0.029	0.0194	Yes
117	TIMM17A	7512	0.029	0.0210	Yes
118	TNNT2	7522	0.028	0.0241	Yes
119	AP3M1	7564	0.027	0.0255	Yes
120	TNPO1	7595	0.027	0.0275	Yes
121	KIF3B	7635	0.026	0.0290	Yes
122	COPG2	7660	0.026	0.0313	Yes
123	OPA1	7665	0.025	0.0347	Yes
124	RPL11	7674	0.025	0.0379	Yes
125	PDIA3	7706	0.025	0.0398	Yes
126	COPB1	7709	0.025	0.0433	Yes
127	ERGIC2	7772	0.024	0.0436	Yes
128	TRPC4AP	7830	0.023	0.0441	Yes
129	KPNA1	7844	0.022	0.0470	Yes
130	NUPL2	7875	0.022	0.0490	Yes
131	ARFIP1	7889	0.021	0.0519	Yes
132	TRAM1	7905	0.021	0.0547	Yes
133	RPAIN	7943	0.020	0.0563	Yes
134	SMG6	7945	0.020	0.0599	Yes
135	XPO6	7979	0.020	0.0617	Yes
136	KPNB1	7983	0.019	0.0652	Yes
137	M6PR	7985	0.019	0.0688	Yes
138	SMG7	8026	0.019	0.0702	Yes
139	ATG4C	8029	0.019	0.0737	Yes
140	COPB2	8069	0.018	0.0752	Yes
141	AP1G1	8083	0.018	0.0781	Yes
142	FLNA	8164	0.016	0.0774	Yes
143	AP3B1	8177	0.016	0.0804	Yes
144	VPS4B	8220	0.015	0.0817	Yes
145	UXT	8222	0.015	0.0853	Yes
146	SMG5	8238	0.015	0.0881	Yes
147	RAB14	8242	0.014	0.0915	Yes
148	PPIH	8284	0.013	0.0929	Yes
149	GOLGA5	8304	0.013	0.0955	Yes
150	PEX26	8457	0.010	0.0908	Yes
151	SEC63	8487	0.009	0.0929	Yes
152	TRNT1	8577	0.007	0.0917	Yes
153	STRADA	8599	0.007	0.0941	Yes
154	COG7	8669	0.005	0.0940	Yes
155	PEX13	8802	0.003	0.0904	Yes
156	MYL6B	8829	0.003	0.0926	Yes
157	TLK1	8868	0.002	0.0942	Yes
158	CTSA	8872	0.002	0.0977	Yes
159	RHOT2	8890	0.001	0.1004	Yes
160	STX18	8931	0.000	0.1018	Yes
161	MAP1S	8952	0.000	0.1043	Yes
162	BET1	9008	-0.001	0.1050	Yes
163	NAPA	9042	-0.002	0.1068	Yes
164	MXI1	9070	-0.002	0.1089	Yes
165	LYST	9117	-0.004	0.1101	Yes
166	BET1L	9296	-0.007	0.1040	Yes
167	COPZ1	9331	-0.008	0.1058	Yes
168	STARD3	9333	-0.008	0.1093	Yes
169	SEC22A	9426	-0.009	0.1079	Yes
170	STX5	9470	-0.010	0.1092	Yes
171	AP3S2	9607	-0.013	0.1054	Yes
172	YWHAH	9617	-0.013	0.1086	Yes
173	BCL2L1	9672	-0.015	0.1092	Yes
174	PEX10	9811	-0.017	0.1053	Yes
175	ERGIC3	9855	-0.018	0.1066	Yes
176	MIPEP	9968	-0.020	0.1041	Yes
177	ANKRD27	10114	-0.023	0.0999	Yes
178	CDC37	10124	-0.023	0.1030	Yes
179	TINAGL1	10141	-0.023	0.1058	Yes
180	MTX2	10187	-0.024	0.1069	Yes
181	RAE1	10222	-0.024	0.1087	Yes
182	PEX7	10240	-0.025	0.1114	Yes
183	LRPPRC	10263	-0.025	0.1138	Yes
184	TMX1	10265	-0.025	0.1174	Yes
185	SNAPIN	10301	-0.026	0.1191	Yes
186	FAF1	10352	-0.027	0.1200	Yes
187	NOP58	10369	-0.027	0.1228	Yes
188	KPNA6	10442	-0.029	0.1225	Yes
189	SCAMP3	10459	-0.029	0.1252	Yes
190	MYO9B	10567	-0.031	0.1230	Yes
191	KLHL2	10614	-0.032	0.1241	Yes
192	PEX3	10646	-0.033	0.1261	Yes
193	NCBP2	10708	-0.034	0.1264	Yes
194	CRYAB	10723	-0.034	0.1292	Yes
195	SSR2	10769	-0.036	0.1304	Yes
196	TAP2	10798	-0.036	0.1325	Yes
197	TOMM34	10891	-0.039	0.1311	Yes
198	DDX19B	10901	-0.039	0.1342	Yes
199	BNIP3	10944	-0.040	0.1356	Yes
200	MDFI	10987	-0.041	0.1369	Yes
201	GOSR2	11104	-0.044	0.1342	Yes
202	TIMM44	11124	-0.045	0.1368	Yes
203	PTTG1IP	11130	-0.045	0.1401	Yes
204	KDELR1	11137	-0.045	0.1434	Yes
205	SLC25A15	11157	-0.045	0.1460	Yes
206	NFKBIL1	11305	-0.049	0.1416	Yes
207	MYBBP1A	11340	-0.050	0.1434	Yes
208	TOMM22	11477	-0.053	0.1396	Yes
209	ABCA2	11582	-0.055	0.1376	Yes
210	EIF5A	11739	-0.059	0.1327	Yes
211	LMAN2L	11751	-0.059	0.1357	Yes
212	TRIP6	11788	-0.060	0.1374	Yes
213	RER1	11861	-0.062	0.1371	Yes
214	DERL2	11897	-0.063	0.1388	Yes
215	DOPEY2	11911	-0.063	0.1417	Yes
216	CCS	11982	-0.065	0.1415	Yes
217	SSR1	12003	-0.065	0.1441	Yes
218	AP3D1	12067	-0.067	0.1443	Yes
219	COPE	12109	-0.068	0.1456	Yes
220	SCAMP2	12164	-0.069	0.1463	Yes
221	KPNA3	12180	-0.069	0.1491	Yes
222	SQSTM1	12290	-0.072	0.1468	Yes
223	YKT6	12410	-0.075	0.1440	Yes
224	NPC1	12486	-0.077	0.1435	Yes
225	COG2	12527	-0.078	0.1449	Yes
226	ATG4B	12529	-0.078	0.1485	Yes
227	GGA1	12628	-0.081	0.1468	Yes
228	USE1	12643	-0.082	0.1497	Yes
229	PEX16	12666	-0.082	0.1521	Yes
230	ZW10	12681	-0.083	0.1549	Yes
231	TAMM41	12899	-0.089	0.1467	Yes
232	TSPO	12900	-0.089	0.1504	Yes
233	PEX14	12932	-0.090	0.1523	Yes
234	NAGPA	12952	-0.090	0.1549	Yes
235	RHOT1	12966	-0.091	0.1578	Yes
236	TIMM23	13005	-0.092	0.1593	Yes
237	RAB35	13015	-0.092	0.1625	Yes
238	TOM1	13038	-0.093	0.1649	Yes
239	ADRB2	13083	-0.094	0.1661	Yes
240	NRBP1	13213	-0.099	0.1627	Yes
241	SMAD3	13263	-0.101	0.1637	Yes
242	HOMER3	13276	-0.101	0.1667	Yes
243	DYNC1I1	13348	-0.103	0.1664	Yes
244	MYL6	13354	-0.104	0.1698	Yes
245	KDELR2	13456	-0.107	0.1679	Yes
246	PPP1R10	13549	-0.110	0.1665	Yes
247	SRSF12	13608	-0.112	0.1670	Yes
248	MYH9	13614	-0.112	0.1703	Yes
249	NLRP3	13686	-0.115	0.1701	Yes
250	CD74	13713	-0.116	0.1723	Yes
251	PEX6	13760	-0.118	0.1734	Yes
252	RPGR	13776	-0.119	0.1762	Yes
253	DDX39A	13795	-0.119	0.1788	Yes
254	ATG4A	13882	-0.123	0.1778	No
255	ATG4D	14347	-0.147	0.1561	No
256	TONSL	14516	-0.154	0.1506	No
257	SLC25A1	14852	-0.175	0.1360	No
258	NFKBIE	14967	-0.183	0.1334	No
259	DDX25	15008	-0.186	0.1348	No
260	TP53	15141	-0.196	0.1312	No
261	HSP90AA1	15217	-0.202	0.1308	No
262	STRADB	15221	-0.202	0.1342	No
263	HTATIP2	15261	-0.205	0.1357	No
264	BCL3	15301	-0.210	0.1372	No
265	KRT18	15767	-0.259	0.1155	No
266	BAK1	15807	-0.264	0.1170	No
267	TNFSF14	15946	-0.281	0.1131	No
268	CRYAA	15966	-0.283	0.1157	No
269	NUDT4	16236	-0.324	0.1047	No
270	BCL6	16262	-0.328	0.1069	No
271	AGXT	16838	-0.465	0.0792	No
272	RTP3	16910	-0.482	0.0790	No
273	APOE	17052	-0.519	0.0749	No
274	KIF1A	17136	-0.549	0.0740	No
275	MYH6	17523	-0.747	0.0566	No
276	NLRP12	17544	-0.764	0.0592	No